液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)以液滴微流控技術(shù)為關(guān)鍵支撐,通過精密微通道設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)微生物或細(xì)胞的單顆粒封裝與精確操控,其關(guān)鍵結(jié)構(gòu)包含液滴生成、操控、培養(yǎng)與分析四大模塊。在液滴生成環(huán)節(jié),系統(tǒng)可通過微流控芯片以高達(dá) 20000 Hz 的頻率生成體積均一的皮升 / 微升級(jí)液滴,將單個(gè)微生物或細(xì)胞與培養(yǎng)基共同包裹其中,形成完全隔離的單獨(dú)培養(yǎng)微環(huán)境。培養(yǎng)模塊采用高透氣性聚合物管路作為容器,可提供可控氧分壓環(huán)境并支持長(zhǎng)達(dá) 60 天的長(zhǎng)時(shí)間孵育,同時(shí)避免瓊脂凝固產(chǎn)生的過氧化氫等抑制性物質(zhì)影響。檢測(cè)分析模塊則集成 OD600、多波段熒光及化學(xué)發(fā)光檢測(cè)功能,配合分選單元實(shí)現(xiàn)目標(biāo)液滴的精確篩選與收集,構(gòu)成 "生成 - 培養(yǎng) - 檢測(cè) - 分選" 的完整技術(shù)閉環(huán)。
該系統(tǒng)廣泛應(yīng)用于合成生物學(xué),用于評(píng)估遺傳電路功能及構(gòu)建人工細(xì)胞群落。吉林原位培養(yǎng)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)

在合成微生物群落構(gòu)建領(lǐng)域,液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)充當(dāng)了“組裝平臺(tái)”。合成生物學(xué)旨在設(shè)計(jì)并構(gòu)建具有特定功能的人工微生物群落,這要求能夠精確控制群落初始的物種組成、比例以及空間結(jié)構(gòu)。液滴微流控技術(shù)通過多級(jí)液滴生成與融合策略,可以像“搭積木”一樣,將不同物種的微生物按照預(yù)設(shè)的比例和組合逐一裝載到統(tǒng)一的微滴單元中。例如,可以首先生成分別包含物種A、B、C的單一菌液滴流,然后通過精確的流量控制將這些單菌液流匯合,再通過被動(dòng)或主動(dòng)(如電融合)的方式促使它們?nèi)诤?,形成包含特定物種組合和細(xì)胞數(shù)量的“設(shè)計(jì)型”合成群落。每個(gè)液滴為此人工群落提供了一個(gè)界限分明、不受外界干擾的進(jìn)化單獨(dú)環(huán)境。研究人員可以在此基礎(chǔ)上,系統(tǒng)研究不同初始條件(如接種比例、空間排列)對(duì)群落結(jié)構(gòu)演替和功能輸出的影響,驗(yàn)證關(guān)于種間互作的理論模型。這種基于液滴的模塊化、高通量構(gòu)建方法,極大地加速了面向特定應(yīng)用(如生物修復(fù)、生物制造)的高效合成群落的篩選與優(yōu)化進(jìn)程,為理解和設(shè)計(jì)復(fù)雜生命系統(tǒng)提供了強(qiáng)有力的工程學(xué)手段。廣東MISS cell液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)在食品工業(yè)中,該系統(tǒng)能高效篩選高產(chǎn)益生菌或風(fēng)味物質(zhì)的優(yōu)良菌株。

微生物液滴培養(yǎng)系統(tǒng)在工業(yè)微生物育種中發(fā)揮著越來越重要的作用。通過將誘變后的微生物細(xì)胞封裝在液滴中進(jìn)行培養(yǎng),可以高通量篩選具有優(yōu)良性狀的突變株。系統(tǒng)通常與熒光液滴分選技術(shù)結(jié)合,根據(jù)目標(biāo)代謝物的產(chǎn)量或底物利用效率對(duì)液滴進(jìn)行分選。例如,在產(chǎn)酶菌種篩選中,通過在液滴中加入熒光底物,能夠直接根據(jù)熒光強(qiáng)度篩選高產(chǎn)菌株。這種篩選方法的通量可達(dá)每天數(shù)百萬個(gè)細(xì)胞,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)平板篩選方法。此外,液滴系統(tǒng)還能模擬工業(yè)發(fā)酵條件,通過控制液滴內(nèi)的營養(yǎng)成分和培養(yǎng)條件,更準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)突變株在規(guī)模化培養(yǎng)中的表現(xiàn)。近年來,該系統(tǒng)已成功應(yīng)用于有機(jī)酸、酶制劑等多種工業(yè)微生物產(chǎn)品的生產(chǎn)菌種選育中,縮短了育種周期。特別值得關(guān)注的是,液滴系統(tǒng)能夠?qū)崿F(xiàn)多參數(shù)同步篩選,例如同時(shí)根據(jù)生長(zhǎng)速率和產(chǎn)物合成能力進(jìn)行篩選,這對(duì)于復(fù)雜性狀的改良尤為重要。
液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)的未來演進(jìn)方向是邁向更高度的集成化和自動(dòng)化,即實(shí)現(xiàn)真正的“芯片實(shí)驗(yàn)室”。這意味著將細(xì)胞捕獲與封裝、培養(yǎng)環(huán)境動(dòng)態(tài)調(diào)控、多步試劑添加、時(shí)序性刺激施加、多模態(tài)檢測(cè)以及功能性分選等多個(gè)操作單元,全部微縮并無縫集成到一張精密的微流控芯片上。這種一體化設(shè)計(jì)能夠?qū)崿F(xiàn)全自動(dòng)、高通量的復(fù)雜生物學(xué)實(shí)驗(yàn)流程,很大限度上減少人為操作引入的誤差和交叉污染。更重要的是,它允許研究人員設(shè)計(jì)并執(zhí)行有時(shí)序控制的動(dòng)態(tài)刺激-響應(yīng)研究,例如先施加一種生長(zhǎng)因子,觀察細(xì)胞早期響應(yīng),再注入第二種信號(hào)分子,研究其組合效應(yīng)與反饋機(jī)制,從而極大地提升生命科學(xué)研究的精確度、復(fù)雜性和通量。
液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)以皮升 / 微升級(jí)液滴為單元,為單細(xì)胞或單菌提供單獨(dú)、隔離的培養(yǎng)微環(huán)境。

在微生物互作研究領(lǐng)域,液滴共培養(yǎng)系統(tǒng)展現(xiàn)出獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。自然界中微生物很少以孤立形式存在,而是通過種間相互作用形成復(fù)雜的生態(tài)網(wǎng)絡(luò)。傳統(tǒng)培養(yǎng)方法難以精確控制多種微生物的空間組織和數(shù)量比例,而液滴系統(tǒng)能夠精確控制不同菌株的封裝比例,實(shí)現(xiàn)一對(duì)一的確定性共培養(yǎng)。研究人員可以將兩種或多種微生物共同封裝在單個(gè)液滴中,研究它們之間的相互作用,包括互利共生、競(jìng)爭(zhēng)抑制和信號(hào)交流等現(xiàn)象。通過調(diào)節(jié)液滴內(nèi)的培養(yǎng)條件,如營養(yǎng)組成和空間結(jié)構(gòu),可以模擬不同的生態(tài)環(huán)境。結(jié)合時(shí)間分辨的顯微鏡觀察和終點(diǎn)分子分析,能夠定量描述微生物互作的動(dòng)力學(xué)過程及其分子機(jī)制。例如,在人類腸道微生物研究中,利用液滴共培養(yǎng)系統(tǒng)揭示了不同細(xì)菌物種如何協(xié)作降解復(fù)雜多糖;在土壤微生物研究中,闡明了生產(chǎn)者與敏感菌之間的生態(tài)關(guān)系。 液滴培養(yǎng)組學(xué)是推動(dòng)功能基因組學(xué)從“是什么”走向“做什么”的關(guān)鍵工具。廣東MISS cell液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)
該系統(tǒng)通過皮升級(jí)液滴封裝,將細(xì)胞培養(yǎng)與篩選的樣本消耗量降至前所未有的水平。吉林原位培養(yǎng)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)
液滴培養(yǎng)組學(xué)正迅速演進(jìn)為一個(gè)強(qiáng)大的多組學(xué)數(shù)據(jù)生成與整合平臺(tái)。其優(yōu)勢(shì)在于能夠?qū)⒓?xì)胞的直接功能表型與其深層的分子genotype精確關(guān)聯(lián)。例如,在完成基于熒光報(bào)告或特定代謝活性的液滴分選后,可以直接對(duì)分選出的目標(biāo)細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序、全基因組測(cè)序或表觀基因組分析,從而精確解讀特定表型背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因突變或染色質(zhì)狀態(tài)。此外,與質(zhì)譜技術(shù)的聯(lián)用也允許對(duì)液滴內(nèi)細(xì)胞的完整代謝物譜進(jìn)行無標(biāo)記、高靈敏度分析。這種“表型-基因型-代謝型”的多維數(shù)據(jù)整合,極大地深化了我們對(duì)細(xì)胞功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的理解,推動(dòng)了從關(guān)聯(lián)分析到機(jī)制闡釋的生物學(xué)研究范式轉(zhuǎn)變。吉林原位培養(yǎng)液滴培養(yǎng)組學(xué)系統(tǒng)
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