圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來(lái)作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下，檢測(cè)到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠，那檢測(cè)的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢？作者也將該方法檢測(cè)到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)預(yù)測(cè)的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中，作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較，也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測(cè)結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外，后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測(cè)了MAZTER-Seq這一系統(tǒng)；并進(jìn)一步通過(guò)這一方法檢測(cè)了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO對(duì)整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù)，其他部分暫不過(guò)多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究?jī)?nèi)容；對(duì)于這一技術(shù)。protocol 分享｜小鼠卵巢組織切片 HE 染色。天津小鼠科研技術(shù)服務(wù)外包

保存于嚴(yán)密緊塞或加蓋的容器里，同時(shí)在容器外上標(biāo)簽，并隨同材料在溶液中投入相應(yīng)的標(biāo)簽，以免相互混淆。標(biāo)簽上注明固定液、材料來(lái)源、日期等。標(biāo)簽上的文字，應(yīng)用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書寫。3.脫水注意事項(xiàng)（1）脫水原理：乙醇與石蠟不相溶，而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當(dāng)組織中全部被二甲苯占有時(shí)，光線可以透過(guò)，組織呈現(xiàn)出不同程度的透明狀態(tài)。（2）脫水必須在有蓋的玻璃品中進(jìn)行，防止吸收空氣中的水分。（3）在更換高一級(jí)的脫水劑時(shí)，不要移動(dòng)材料以免損壞，可用吸管吸出器皿中的脫水劑，再用吸水吸盡器皿內(nèi)剩余液，然后于皿中加入高一級(jí)脫水劑。（4）在低濃度酒精中，每級(jí)停留不宜太長(zhǎng)，否則易使組織變軟，助長(zhǎng)材料的解體。（5）在高濃度或純酒精中，每級(jí)停留的時(shí)間也不宜太長(zhǎng)，否則會(huì)使組織變脆，影響切片。（6）如需過(guò)夜，應(yīng)停留在70%酒精中。（7）脫水必須徹底，否則不易透明，甚至使透明劑內(nèi)出現(xiàn)白色混濁現(xiàn)象。4.透明注意事項(xiàng)（1）使用透明劑時(shí)，要隨時(shí)蓋緊蓋子，以免空氣中的水分進(jìn)入。（2）更換每級(jí)透明劑，動(dòng)作要迅速，一方面為了不使材料塊干涸，另一方面能避免吸收濕氣。（3）在透明過(guò)程中，如果材料周圍出現(xiàn)白色霧狀，說(shuō)明材料中的水未被脫凈。海南裸鼠科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)干貨分享 | PCR反應(yīng)污染原因追蹤及污染處理方法。

|基因組DNA擴(kuò)增|RNA擴(kuò)增|克隆與表達(dá)克隆基因|克隆試劑盒|克隆篩選|感受態(tài)細(xì)胞|突變轉(zhuǎn)染|轉(zhuǎn)化|體外轉(zhuǎn)錄/翻譯|其它表達(dá)分析Northern印跡分析|分支DNA和mRNA定量|差別基因表達(dá)|反義寡核苷酸|RACE試劑盒|SAGE試劑盒|其它抗體蛋白A,GPLUS|抑制/凋亡抗體|信號(hào)分子抗體結(jié)構(gòu)蛋白抗體|磷酸化特異抗體|融合蛋白tag抗體非哺乳動(dòng)物蛋白抗體|細(xì)胞周期蛋白抗體|轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白抗體|抗體制備佐劑|抗體片段|抗體同種型|抗體純化|抗體制備試劑盒|其它第二抗體westernblot二抗|免疫組化二抗|其它試劑盒ELISA試劑盒|免疫組化試劑盒|放射免疫試劑盒|westernblot試劑盒|流式細(xì)胞試劑盒|其它抗體相關(guān)siRNA|重組蛋白|白蛋白|試劑|其它分子生物學(xué)服務(wù)DNA提取/純化|DNA測(cè)序|第二代高通量測(cè)序|DNA保存和活化|基因合成|基因步行|基因組分析生物信息學(xué)|SNP檢測(cè)|實(shí)時(shí)定量PCR服務(wù)|文庫(kù)/載體構(gòu)建|寡核苷酸合成Oligo合成|實(shí)時(shí)PCROligo合成|其它細(xì)胞生物學(xué)服務(wù)細(xì)胞培養(yǎng)|流式細(xì)胞檢測(cè)|細(xì)胞毒性測(cè)試|細(xì)胞因子生物檢測(cè)|影像服務(wù)|篩選/發(fā)育服務(wù)|其它干細(xì)胞技術(shù)服務(wù)干細(xì)胞提取|干細(xì)胞鑒定|干細(xì)胞誘導(dǎo)分化|干細(xì)胞常規(guī)檢測(cè)|干細(xì)胞擴(kuò)增|干細(xì)胞轉(zhuǎn)基因|干細(xì)胞其他相關(guān)實(shí)驗(yàn)|微生物學(xué)服務(wù)微生物鑒定|抑菌作用測(cè)試|內(nèi)測(cè)試|內(nèi)。

我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣，一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短，從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天，我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì)，蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過(guò)程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn)，一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中，二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注，然后冰上取腦，分離各腦區(qū)(嗅球，皮層，海馬，中腦，小腦，延髓，丘腦，紋狀體)后置于，用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長(zhǎng)期保存。接著是保證蛋白濃度，即要加入適量的裂解液，加太少會(huì)使蛋白提取不充分，加太多會(huì)讓蛋白濃度太低，一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的，細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液，動(dòng)物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理，具體方案見(jiàn)討論部分。如果沒(méi)有超聲破碎儀，那就用1毫升注射器不斷抽吸，冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右，注意不要產(chǎn)生過(guò)多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取，由于文件過(guò)大，又比較血腥，不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘，這里的上樣緩沖液有兩種可選。細(xì)胞核是細(xì)胞的控制中心，它包含了遺傳物質(zhì)DNA，控制著細(xì)胞的生長(zhǎng)和分裂。

如果實(shí)驗(yàn)平臺(tái)的儀器需要提前預(yù)約，建議提前規(guī)劃好使用的時(shí)間。反復(fù)總結(jié)尋找答案在整個(gè)預(yù)實(shí)驗(yàn)的過(guò)程中可能會(huì)出現(xiàn)很多問(wèn)題。比如造模效果欠佳、灌胃操作不當(dāng)、腹腔注射操作失誤、使用不當(dāng)?shù)纫饎?dòng)物死亡。每遇到問(wèn)題都需要自己想辦法解決，可以從導(dǎo)師、師兄師姐、文獻(xiàn)、貼吧、視頻教程等找到答案。比如筆者曾遇到同樣的給，發(fā)現(xiàn)有的大鼠得很深，有的大鼠還活蹦亂跳，在反復(fù)嘗試調(diào)整濃度，給劑量，更換方式，后來(lái)才發(fā)現(xiàn)是動(dòng)物體重秤的準(zhǔn)度有問(wèn)題，導(dǎo)致體重秤得不準(zhǔn)。因此，需要自己反復(fù)琢磨到底是實(shí)驗(yàn)過(guò)程中哪一個(gè)環(huán)節(jié)出現(xiàn)問(wèn)題，逐一排除。也要求在每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟需要標(biāo)準(zhǔn)化，統(tǒng)一化，盡可能的排除干擾因素，這樣方便在遇到問(wèn)題快的找到答案。同時(shí)，建議每日總結(jié)，大到動(dòng)物死亡原因分析，小到灌胃操作耗時(shí)多長(zhǎng)時(shí)間。建議反復(fù)總結(jié)出每天實(shí)驗(yàn)的優(yōu)缺點(diǎn)。做任何一個(gè)操作之前，建議提前腦海中反復(fù)模擬，準(zhǔn)備好相關(guān)工具和試劑，避免臨用之際缺少的，影響實(shí)驗(yàn)操作節(jié)奏和個(gè)人心情。筆者曾經(jīng)灌胃操作的時(shí)候發(fā)現(xiàn)竟然忘帶了，只好重新回實(shí)驗(yàn)室準(zhǔn)備，那真叫一個(gè)郁悶。仔細(xì)記錄每日實(shí)驗(yàn)過(guò)程無(wú)論是碩士還是博士，導(dǎo)師給我們上的堂課往往就是交代我們要詳細(xì)記好實(shí)驗(yàn)記錄，只要是和實(shí)驗(yàn)相關(guān)的。飼養(yǎng)動(dòng)物及干預(yù) 動(dòng)物購(gòu)買后需要將時(shí)間節(jié)點(diǎn)提前規(guī)劃好。北京病理科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)

科研技術(shù)服務(wù)致力于推動(dòng)前沿科技的研究與發(fā)展，為企業(yè)提供定制化的技術(shù)解決方案。天津小鼠科研技術(shù)服務(wù)外包

是整體甲基化進(jìn)程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員，作為個(gè)被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶，可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力，進(jìn)而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過(guò)程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長(zhǎng)遲緩相關(guān)，揭示m6A可能對(duì)這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個(gè)成員，以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位，它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外，ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7]，且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常，這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達(dá)改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過(guò)兩個(gè)途徑：精細(xì)調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)，以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用；或被直接由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別，誘發(fā)續(xù)反應(yīng)。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2己被證實(shí)是ｍ６Ａ的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響ｍ６Ａ修飾基因的翻譯，YTHDF2主要影響ｍ６Ａ修飾基因的降解，而YTHDC1結(jié)合ｍ６Ａ修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白，參與pre-mRNA的加工[8]。天津小鼠科研技術(shù)服務(wù)外包