m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。動物疾病模型還為科研人員提供了研究人類疾病的跨學科方法。山西兔科研技術服務分離
應退回純酒精中重新脫水,然后再透明,否則切片難以鏡檢。(4)二甲苯應盡量保持無水,應經常更換,或用紗布包無水硫酸銅放入染色缸內吸收水分。5.透蠟注意事項(1)透蠟的目的是除去組織中的透明劑(如二甲苯等),使石蠟滲透到組織內部達到飽和程度以便包埋。透蠟時間根據組織大小而定。(2)盡量保持在較低溫度中進行,以石蠟不凝固為度。(3)透蠟溫度要恒定,不可忽高忽低。(4)操作要迅速,力求在短的時間內完成石蠟透入過程,以免引起組織變硬、變脆、收縮等。(5)注意溫度不要過高,以免組織發(fā)脆。6.染色水洗注意事項(1)染色原理:伊紅主要染細胞質,著色濃淡應與蘇木精染細胞核的濃淡相配合,如果細胞核染色較濃,細胞質也應濃染,以獲得鮮明的對比。(2)染色時間應根據染色劑的成熟程度及室溫高低,適當縮短或延長。室溫高時促進染色,染色時間可短些,否則可適當延長時間,冬季室溫低時可放入恒溫箱中染色。(3)注意流水不能過大,以防切片脫落。(4)如果細胞核染色較淺,細胞質也應淡染??稍谝良t乙醇液中滴加數滴冰醋酸助染,促使細胞質容易著色,并且經乙醇脫水時不易褪色。廣西病理科研技術服務服務常見的5種實驗動物取血方式,你掌握幾種?
在人類疾病研究中數據表明,常用實驗動物模型按產生原因分為以下5類:自發(fā)性動物模型、誘發(fā)型動物模型、遺傳工程動物模型、生物醫(yī)學動物模型和陰性動物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧:1、自發(fā)性動物模型:是指動物未經任何有意識的人工處理,在自然條件下或基因突變條件下所產生的疾病模型。主要包括突變型的遺傳病模型和近郊系的疾病模型。2、誘發(fā)型動物模型:亦稱實驗性動物模型。是使用物理、化學或生物致病因素誘導動物產生某些類似人類疾病表現而制備的動物模型。此模型具有制備方法簡單,實驗條件容易控制,重復性好等特點,廣泛應用于藥物篩選、毒理、傳染病、病理機制的研究。3、遺傳工程動物模型:是利用遺傳工程技術對動物基因組進行修飾,用于研究基因功能或疾病機制的動物模型。也稱基因修飾動物模型,是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術有目的的干預動物的遺傳組成,導致動物出現新的性狀,并使其能夠有效地遺傳下去,形成新的可供生命科學研究的和其他目的所用的動物模型。4、生物醫(yī)學動物模型:也是指利用健康生物的特定生物學特征,研究人類疾病相似表現得模型。這類動物模型與人類疾病存在一定的差異,研究者應加以比較,從中獲得有關材料。
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應取有細支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進行多樣本的采集,采集順序應按照:消化,神經系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等,應盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應用經常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內部或需要對整個臟器或整個動物進行固定,這時宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經血管分支到達整個和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進行保存,如果空腔中氣體沒有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒有灌注的肺會浮在液體表面不利于固定,切片以后也會看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細小而薄的標本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細胞涂片以及某些薄膜的固定。。瘤細胞的增殖活性,從而更好地評估腫、瘤的惡性程度和預后.
啟醫(yī)療,個體化用藥貝克曼庫爾特細胞專題--助力病毒載體純化、細胞特性分析產品庫儀器設備耗材試劑抗體技術服務生物芯片芯片掃描儀|芯片點樣儀|生物芯片系統(tǒng)|生物芯片|其它測讀系統(tǒng)洗板機|多功能篩選系統(tǒng)|大型分析系統(tǒng)|化學發(fā)光檢測儀|分光光度計|其它|光譜系統(tǒng)原子吸收光譜儀|可見光光譜儀|熒光光譜儀|紅外光譜儀|近紅外光譜儀|LIBS光譜儀|拉曼光譜儀|紫外/可見/近紅外光譜儀|其它分子生物實驗儀器電泳設備|紫外設備|普通PCR儀|定量PCR儀|數字PCR儀|DNA/有機/多肽合成|轉基因儀|其它顯微系統(tǒng)倒置顯微鏡|實體顯微鏡|生物顯微鏡|電子顯微鏡其它顯微鏡|顯微操縱|附件和濾光片|其它色譜系統(tǒng)液相色譜系統(tǒng)|制備液相色譜系統(tǒng)|毛細管LC系統(tǒng)氣相色譜系統(tǒng)|離子色譜系統(tǒng)|色譜系統(tǒng)檢測器樣品管理工具|色譜系統(tǒng)附件質譜系統(tǒng)飛行質譜|四極桿質譜|離子阱質譜|等離子質譜|毛細管電泳/質譜聯用系統(tǒng)|雜交質譜|質譜標準品|其它實驗室自動化氨基酸分析系統(tǒng)|蛋白純化系統(tǒng)|蛋白質翻譯系統(tǒng)|全自動分液系統(tǒng)|核酸提取純化全自動血液采樣系統(tǒng)|基因組/蛋白組設備DNA測序儀|全基因組測序儀|基因分型系統(tǒng)|雙向電泳系統(tǒng)|蛋白質純化|蛋白質斑點切取系統(tǒng)|其它神經生物學儀器動物功能檢測設備|動物處理設備|。實驗干貨 | 分子克隆實驗——無縫克隆。天津乳鼠科研技術服務分離
動物疾病模型可以分為兩種類型:自然模型和人工模型。山西兔科研技術服務分離
m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數量及分布,Peak關聯基因的特征,聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質重構。近。山西兔科研技術服務分離