是整體甲基化進程所必須的[2]。FTO是ALKB家族的成員,作為個被發(fā)現(xiàn)的去甲基酶,可影響剪切因子SRSF2的RNA結(jié)合能力,進而調(diào)控pre-mRNA的剪切加工過程[3]。目前已發(fā)現(xiàn)FTO調(diào)節(jié)異常與肥胖、大腦畸形和生長遲緩相關(guān),揭示m6A可能對這些疾病具有重要的調(diào)節(jié)功能[4-6]。ALKBH5是ALKB家族中被發(fā)現(xiàn)具有去甲基作用的另一個成員,以RNaseA敏感的方式與核小斑共定位,它可直接催化m6A-甲基化腺苷去除甲基而不同于FTO的氧化去甲基化[7].此外,ALKBH5和它的去甲基化活性影響新生mRNA合的成和剪切效率[7],且ALKBH5敲除雄性小鼠表現(xiàn)出精子發(fā)生異常,這可能是精子發(fā)生相關(guān)基因表達改變的結(jié)果[7]。m6AmRNA修飾執(zhí)行其功能主要通過兩個途徑:精細調(diào)控甲基化轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu),以阻止或誘使蛋白-RNA相互作用;或被直接由m6A結(jié)合蛋白識別,誘發(fā)續(xù)反應(yīng)。目前一類含有YTH功能結(jié)構(gòu)域的蛋白被鑒定為m6A修飾的結(jié)合蛋白。其中YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2己被證實是m6A的結(jié)合蛋白.YTHDF1主要影響m6A修飾基因的翻譯,YTHDF2主要影響m6A修飾基因的降解,而YTHDC1結(jié)合m6A修飾的基因影響其剪接。HNRNPC是一種豐富的核RNA結(jié)合蛋白,參與pre-mRNA的加工[8]。EdU細胞增殖檢測是一種快速、準確、靈敏的細胞增殖檢測方法.黑龍江病理科研技術(shù)服務(wù)實驗

采用opti-MEM和Lipo3000分別轉(zhuǎn)染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質(zhì)粒及對照載體,每皿加入脂質(zhì)體-質(zhì)粒轉(zhuǎn)染混懸液按購買脂質(zhì)體相關(guān)說明書操作定量。繼續(xù)培養(yǎng)24h。2)24小時后,將培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完全培養(yǎng)基,放進細胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48~72h。3)48~72h后收集上層培養(yǎng)液,并過μm濾膜,采用ELISA法對所獲得的慢載體進行滴度測定。如不及時使用可以凍存于-80℃。3、慢轉(zhuǎn)染1)轉(zhuǎn)染前1天將細胞接種6孔培養(yǎng)板,時細胞的融合率約為50%,前需換液,加入1mLDMEM完全培養(yǎng)基。2)冰浴融化后加入相應(yīng)體積的液及聚凝胺(Polybrene),混勻后放入37℃孵箱中繼續(xù)培養(yǎng)3)4h后補充1mL培養(yǎng)基,14h后換液(24h內(nèi)換液即可)。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光,監(jiān)測效率,出現(xiàn)較多熒光時將等量的轉(zhuǎn)染細胞和未轉(zhuǎn)染細胞分別加入等濃度Puromycin(Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索)。5)待未轉(zhuǎn)染細胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時,降低Puromycin濃度培養(yǎng)。也可以挑去單克隆細胞株進行進一步培養(yǎng),以得到滿意的穩(wěn)定表達目的基因的細胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細胞株:a.正常細胞株;b.空載載體的細胞株。江蘇兔科研技術(shù)服務(wù)實驗室飼養(yǎng)動物及干預(yù) 動物購買后需要將時間節(jié)點提前規(guī)劃好。

轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示精子發(fā)生相關(guān)基因的表達和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。YTHDC2可促進靶基因的翻譯效率,并降低其mRNA的豐度,在精子發(fā)生過程中起關(guān)鍵作用。當減數(shù)分裂開始時YTHDC2表達上調(diào),YTHDC2敲除小鼠的生殖細胞沒有經(jīng)過偶線期的發(fā)育導(dǎo)致小鼠不育[20]。在DNA損傷反應(yīng)中,METTL3可促進DNA聚合酶κ(Polκ)與核酸剪切修復(fù)途徑快速定位到UV引起的DNA損傷位點,當缺失METTL3時,細胞無法迅速修復(fù)UV照射引起的突變,并且對UV照射更加敏感[25]。在淋巴細胞性小鼠過繼轉(zhuǎn)移模型中,Mettl3缺陷通過影響mRNAm6A修飾,降低SOCS家族mRNA衰減,增加mRNA和蛋白表達水平,從而抑制IL-7介導(dǎo)的STAT5活性和T細胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)增殖和分化,進而抑制腸炎的發(fā)生[21]。在肝中,METTL14通過調(diào)控pri-miRNA的m6A修飾,影響MiR-126的生成加工,從而抑制肝的轉(zhuǎn)移[22]。在乳腺細胞中,低氧刺激能促進依賴低氧誘導(dǎo)因子HIF的ALKBH5的表達,而ALKBH5過表達降低了NANOGmRNA的m6A修飾,從而穩(wěn)定mRNA提高NANOG的表達水平,終增加乳腺干細胞所占的比例[23]。此外,低氧誘導(dǎo)乳腺細胞中依賴ZNF217的NANOG和KLF4的mRNAm6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除降低免疫缺陷小鼠乳腺的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺中。
m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。干貨分享 | PCR反應(yīng)污染原因追蹤及污染處理方法。

原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個質(zhì)粒:質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒,其同時含有目的基因和報告基因,psPAX2是可以表達慢病毒外殼的質(zhì)粒,其表達產(chǎn)物可通過粘附機制更易穿過細胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒,通過脂質(zhì)體進行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細胞基因組中,宿主基因組在表達時,隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進入細胞后,其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA,該基因再整合到靶細胞的基因組中,完成轉(zhuǎn)染過程。因為質(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達目的基因卻不能表達出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細胞能反復(fù)增殖,故對宿主細胞是無害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生,包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS,對數(shù)期293T細胞,細胞計數(shù)器,病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細胞鋪板取對數(shù)生長期的293T細胞,用的胰蛋白酶消化293T細胞,計數(shù)。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細胞均勻鋪入。若是6孔板。細胞增殖與細胞凋亡、細胞周期等是研究的重要表型,是分子生物學(xué)和藥理學(xué)研究解決的問題之一。河北科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
將Transwell小室放入配套培養(yǎng)板中,形成由細胞可穿透性膜分隔開的兩室系統(tǒng),將高營養(yǎng)液與低營養(yǎng)液分隔開。黑龍江病理科研技術(shù)服務(wù)實驗
中華文化促進會文化創(chuàng)新與傳播委員會會長朱建聲、西安海棠學(xué)院院長馮居秦、西安交通大學(xué)人文學(xué)院EDP中心主任、中華風(fēng)采人物媒體社長王天保、西安市EMBA助企商會會長張西安、陜西省糖尿病協(xié)會副會長張麗、陜西省養(yǎng)生協(xié)會會長李靖、陜西省職業(yè)經(jīng)理人協(xié)會名譽會長劉志超、西藏鷹山科技集團董事長張沛、西安天歌干細胞健康管理中心總經(jīng)理楊海軍和團隊及各行各業(yè)企業(yè)界朋友、受益者近200人參與了活動。西安天歌干細胞健康管理有限公司總經(jīng)理楊海軍介紹了成立一年來的工作情況和未來的發(fā)展布局。隨后,天歌干細胞健康管理中心負責(zé)人分別同中華文化促進會文化創(chuàng)新與傳播委員會會長朱建聲;西安市(EMBA助企商會)/西安市EMBA商會會長張西安;鄭州天歌干細胞健康管理有限公司總經(jīng)理張永紅和上海豪景醫(yī)療器械有限公司總經(jīng)理張建國進行了簽約儀式。主持人同中華風(fēng)采人物媒體社長、新時代風(fēng)采人物研究會會長、文化名人收藏大家王天保,中華風(fēng)采人物媒體主編李西紅,西藏鷹山科技集團董事長張沛分別從幾個話題闡述和討論了大健康產(chǎn)業(yè)的未來前景。為了答謝各界朋友的的支持與厚愛,活動舉行了現(xiàn)場抽獎環(huán)節(jié),將活動掀起了高潮。通過活動一方面讓大家和身邊的朋友更關(guān)注健康。黑龍江病理科研技術(shù)服務(wù)實驗