20世紀(jì)90年代后,隨著分子生物學(xué)和合成生物學(xué)的進(jìn)步,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)技術(shù)迎來突破。研究者通過優(yōu)化裂解物制備(如敲除大腸桿菌核酸酶)、開發(fā)能量再生系統(tǒng)(如Phosphoenolpyruvic acid,PEP循環(huán)),明顯提升蛋白產(chǎn)量和反應(yīng)時(shí)長。2000年代初,連續(xù)交換式反應(yīng)體系(CECF)的出現(xiàn)解決了底物耗盡問題,使反應(yīng)時(shí)間延長至24小時(shí)以上,產(chǎn)量達(dá)毫克級(jí),為工業(yè)化鋪平道路。此階段,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)開始應(yīng)用于毒性蛋白合成和抗體片段生產(chǎn),但成本仍較高。例如HIV蛋白酶在通過體外蛋白表達(dá)后仍切割底物蛋白,但其毒性被限制在封閉體系內(nèi)。低溫誘導(dǎo)蛋白表達(dá)載體
通過同步測試不同CD19蛋白構(gòu)建序列、可溶性標(biāo)簽及蛋白表達(dá)參數(shù),eProteinDiscovery可在24小時(shí)內(nèi)快速確定合適的蛋白表達(dá)條件,并在48小時(shí)內(nèi)獲得目標(biāo)蛋白。這一能力使研究人員能夠快速開展蛋白靶點(diǎn)鑒定及疾病機(jī)制相關(guān)蛋白的驗(yàn)證工作。該系統(tǒng)整合數(shù)字微流控技術(shù)、蛋白質(zhì)質(zhì)量分析及無細(xì)胞蛋白合成技術(shù),即使對(duì)于Zui難表達(dá)的蛋白質(zhì)也能實(shí)現(xiàn)快速制備,從而大幅簡化了Zhi liao性研究與開發(fā)的流程。KEY英國Nuclera公司由劍橋大學(xué)的博士生們于2013年創(chuàng)立。在撰寫論文期間,他們發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)難以獲取的問題是生物學(xué)領(lǐng)域的重要障礙和瓶頸。他們著手解決蛋白質(zhì)難以獲取的問題,以期改善人類健康狀況。公司的愿景是打造出從DNA到蛋白質(zhì)的原型設(shè)計(jì)系統(tǒng),以減少在藥物發(fā)現(xiàn)計(jì)劃中獲得靶蛋白的時(shí)間和障礙。重組蛋白表達(dá)的局限CHO細(xì)胞重組蛋白表達(dá)??是生產(chǎn)抗體的常用技術(shù)。
體外蛋白表達(dá)系統(tǒng)的hexin在于重構(gòu)細(xì)胞質(zhì)環(huán)境中的核糖體翻譯機(jī)器。該過程起始于mRNA5'端與核糖體小亞基的結(jié)合,由起始因子(如原核IF1/2/3或真核eIF4F復(fù)合物)介導(dǎo)形成翻譯起始復(fù)合物。肽鏈延伸階段依賴延伸因子EF-Tu準(zhǔn)確運(yùn)送氨酰tRNA至A位點(diǎn),并通過其GTP水解活性確保密碼子-反密碼子配對(duì)的保真度。體外蛋白表達(dá)的高效率源于反應(yīng)底物濃度的可調(diào)控性—在去除了細(xì)胞膜屏障的無細(xì)胞環(huán)境中,ATP濃度可提升至生理水平的5-8倍(4-6mM),使核糖體延伸速率高達(dá)21個(gè)氨基酸/秒。同時(shí),磷酸肌酸(PCr)-肌酸激酶(CK)組成的能量再生系統(tǒng)持續(xù)將ADP還原為ATP,維持反應(yīng)體系48小時(shí)以上的持續(xù)活性,大幅提升了目標(biāo)產(chǎn)物的積累效率。
eProteinDiscovery系統(tǒng):一種將無細(xì)胞蛋白合成與數(shù)字微流控相結(jié)合的快速蛋白質(zhì)原型系統(tǒng)傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)表達(dá)純化流程十分依賴人工操作,并且往往需要幾周甚至更久。無細(xì)胞蛋白表達(dá)的興起可將這一時(shí)間縮短至十幾個(gè)小時(shí),但是仍需要現(xiàn)進(jìn)行表達(dá)載體的制備,體外擴(kuò)增和高通量蛋白表達(dá)然后再進(jìn)行篩選等多步操作。Nuclera將這些復(fù)雜的流程ji he到eProteinDiscovery系統(tǒng)。該系統(tǒng)使用基于數(shù)字微流控的智能卡盒、無細(xì)胞蛋白質(zhì)合成和熒光蛋白檢測技術(shù),使研究人員更容易大規(guī)模獲取高質(zhì)量蛋白質(zhì)。只要將目標(biāo)蛋白質(zhì)的序列輸入配套軟件,就可以利用預(yù)設(shè)融合標(biāo)簽定制DNA構(gòu)建體以優(yōu)化表達(dá),然后將表達(dá)載體裝載到機(jī)器上,該系統(tǒng)就會(huì)通過自動(dòng)化構(gòu)建篩選(可同時(shí)篩24種構(gòu)建體x8種無細(xì)胞混合物=192種表達(dá)條件),在48小時(shí)內(nèi),根據(jù)可溶性、可純化性和純化產(chǎn)量數(shù)據(jù)確定Zui Jia表達(dá)條件,然后放大規(guī)模并獲取蛋白質(zhì)以供下游應(yīng)用。該工作流程jin需3步,可生產(chǎn)18kDa~300kDa的蛋白質(zhì),還更容易地篩選和獲取同源物、直系同源物、突變和異構(gòu)體。大腸桿菌裂解物的??高翻譯效率??可支持??100μg/mL級(jí)??蛋白產(chǎn)量,但缺乏糖基化修飾能力。
tumor靶向zhi liao需快速檢測患者特異性生物標(biāo)志物?;隗w外蛋白表達(dá)的液態(tài)活檢-功能驗(yàn)證平臺(tái)將ctDNA突變轉(zhuǎn)化為功能蛋白:從患者血漿提取BRAFV600E突變DNA,加入兔網(wǎng)織紅細(xì)胞裂解物表達(dá)突變激酶,再通過微流控芯片檢測其與抑制劑Dabrafenib的結(jié)合力(Clin.CancerRes.,2023)。全程只需8小時(shí)(傳統(tǒng)細(xì)胞驗(yàn)證需2周),指導(dǎo)黑色素瘤準(zhǔn)確用藥的準(zhǔn)確率達(dá)92%。該技術(shù)正拓展至EGFR/ALK融合蛋白檢測,推動(dòng)個(gè)體化醫(yī)療進(jìn)程。英國nuclera蛋白質(zhì)打印機(jī)可鋪助體外蛋白表達(dá),更多產(chǎn)品信息,可咨詢上海曼博生物!大腸桿菌裂解物??是經(jīng)濟(jì)的體外蛋白表達(dá)平臺(tái)。重組蛋白表達(dá)的局限
小麥胚芽裂解物??則憑借??低核酸酶活性??成為長期反應(yīng)(>24小時(shí))的理想選擇。低溫誘導(dǎo)蛋白表達(dá)載體
將體外蛋白表達(dá)推向規(guī)模化生產(chǎn)需解決三大he xin瓶頸:裂解物制備標(biāo)準(zhǔn)化問題:不同批次細(xì)胞破碎效率差異導(dǎo)致核酸酶/蛋白酶殘留量波動(dòng)(CV>15%),造成翻譯活性離散度超20%。能量再生持續(xù)性不足:即使采用多酶耦聯(lián)再生系統(tǒng)(如pyruvate kinase,PK-肌激酶級(jí)聯(lián)),ATP濃度常在反應(yīng)啟動(dòng)6小時(shí)后衰減至閾值(<1 mM)以下,大幅限制長時(shí)程蛋白表達(dá)效率。產(chǎn)物濃度天花板效應(yīng):受限于核糖體組裝速率(約10個(gè)核糖體/分鐘/條mRNA),當(dāng)前比較高產(chǎn)量只達(dá)5-8 g/L,較CHO細(xì)胞灌注培養(yǎng)系統(tǒng)(>10 g/L)仍有明顯差距。為突破這些限制,前沿策略聚焦于 工程化裂解物開發(fā)—通過CRISPR敲除宿主核酸酶基因(如RNase E)并將關(guān)鍵翻譯因子過表達(dá)100倍以上,使體外蛋白表達(dá)系統(tǒng)的批間穩(wěn)定性提升至CV<5%,ATP維持時(shí)間延長至24小時(shí)以上,明顯提升了工業(yè)轉(zhuǎn)化潛力。低溫誘導(dǎo)蛋白表達(dá)載體