m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。流式細胞周期檢測試劑盒是一種用于研究細胞周期的重要工具。寧夏乳鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗
建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。因此,疾病模型研究結(jié)果的可靠程度取決于模型與人類疾病的相似或可比擬的程度。接下來就讓上海研錄帶您了解相關(guān)知識。一個好的疾病模型應(yīng)具有以下特點:①能夠再現(xiàn)所要研究的人類疾病,動物疾病表現(xiàn)應(yīng)該與人類疾病相似;②動物能重復(fù)產(chǎn)生該疾病,盡可能能在兩種動物體內(nèi)復(fù)制該?。虎蹌游锉尘百Y料完整,實驗動物合格,生命周期要滿足實驗需要;④動物要價廉、來源充足、便于運送;⑤盡可能選用小動物。生物醫(yī)學(xué)科研專業(yè)設(shè)計中常要考慮如何建立動物模型的問題,因為很多闡明疾病及療效機制的實驗不可能或不應(yīng)該在患者身上進行。常要依賴于復(fù)制動物模型,但一定要進行周密設(shè)計,設(shè)計時要遵循下列一些原則:(一)相似性在動物身上復(fù)制人類疾病模型,目的在于從中找出可以推演應(yīng)用于患者的有關(guān)規(guī)律。外推法(extrapolation)要冒風(fēng)險,因為動物與人到底不是一種生物。如,在動物身上無效的藥物不等于臨床無效,反之亦然。因此,設(shè)計動物疾病模型的一個重要原則是,所復(fù)制的模型應(yīng)盡可能近似于人類疾病的情況。能夠找到與人類疾病相同的動物自發(fā)性疾病當(dāng)然是比較好的。(二)重復(fù)性理想的動物模型應(yīng)該是可重復(fù)的,甚至是可以標(biāo)準化的。如。寧夏乳鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗科研小白如何摸索自己的預(yù)實驗。
啟醫(yī)療,個體化用藥貝克曼庫爾特細胞專題--助力病毒載體純化、細胞特性分析產(chǎn)品庫儀器設(shè)備耗材試劑抗體技術(shù)服務(wù)生物芯片芯片掃描儀|芯片點樣儀|生物芯片系統(tǒng)|生物芯片|其它測讀系統(tǒng)洗板機|多功能篩選系統(tǒng)|大型分析系統(tǒng)|化學(xué)發(fā)光檢測儀|分光光度計|其它|光譜系統(tǒng)原子吸收光譜儀|可見光光譜儀|熒光光譜儀|紅外光譜儀|近紅外光譜儀|LIBS光譜儀|拉曼光譜儀|紫外/可見/近紅外光譜儀|其它分子生物實驗儀器電泳設(shè)備|紫外設(shè)備|普通PCR儀|定量PCR儀|數(shù)字PCR儀|DNA/有機/多肽合成|轉(zhuǎn)基因儀|其它顯微系統(tǒng)倒置顯微鏡|實體顯微鏡|生物顯微鏡|電子顯微鏡其它顯微鏡|顯微操縱|附件和濾光片|其它色譜系統(tǒng)液相色譜系統(tǒng)|制備液相色譜系統(tǒng)|毛細管LC系統(tǒng)氣相色譜系統(tǒng)|離子色譜系統(tǒng)|色譜系統(tǒng)檢測器樣品管理工具|色譜系統(tǒng)附件質(zhì)譜系統(tǒng)飛行質(zhì)譜|四極桿質(zhì)譜|離子阱質(zhì)譜|等離子質(zhì)譜|毛細管電泳/質(zhì)譜聯(lián)用系統(tǒng)|雜交質(zhì)譜|質(zhì)譜標(biāo)準品|其它實驗室自動化氨基酸分析系統(tǒng)|蛋白純化系統(tǒng)|蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)|全自動分液系統(tǒng)|核酸提取純化全自動血液采樣系統(tǒng)|基因組/蛋白組設(shè)備DNA測序儀|全基因組測序儀|基因分型系統(tǒng)|雙向電泳系統(tǒng)|蛋白質(zhì)純化|蛋白質(zhì)斑點切取系統(tǒng)|其它神經(jīng)生物學(xué)儀器動物功能檢測設(shè)備|動物處理設(shè)備|。
外泌體生物發(fā)生和神經(jīng)元細胞中分泌小泡的調(diào)節(jié)之間的交集為外泌體和神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病機制之間假定的聯(lián)提供了新的見解。與研究外泌體在其他疾病中的作用相比,外泌體中的研究進展迅速,而且外泌體與的幾個主要特征有關(guān)。外泌體影響、生長和轉(zhuǎn)移、副綜合征和耐藥性。外泌體在進展中的作用可能是動態(tài)的,并且與的類型、遺傳學(xué)和分期有關(guān)。外泌體的應(yīng)用外泌體用于免疫基于免疫細胞來源的外泌體能夠介導(dǎo)和調(diào)節(jié)機體對的免疫反應(yīng),外泌體在免疫方面的潛力受到關(guān)注。其中樹枝狀細胞產(chǎn)生的外泌體包含大量的MHC-多肽復(fù)合物和免疫刺激相關(guān)的分子,能夠相關(guān)的T細胞,介導(dǎo)體內(nèi)抗應(yīng)答,在多個臨床試驗中表現(xiàn)出良好的抗療效。有研究者考察了樹枝狀細胞外泌體對非小細胞肺患者的療效。結(jié)果表明,患者對樹枝狀細胞外泌體耐受性良好,1/3患者表現(xiàn)出了對樹枝狀細胞外泌體的T細胞響應(yīng),2/4患者自然殺傷細胞活性得以。另有研究者公布了利用自體樹突狀細胞外泌體免疫轉(zhuǎn)移性黑色素瘤的臨床一期試驗結(jié)果,發(fā)現(xiàn)自體樹突狀細胞外泌體無明顯毒性,并且具有刺激自然殺傷細胞的能力。以上臨床試驗證明了外泌體免疫療法的安全性和可行性,為進一步臨床研究奠定了基礎(chǔ)。動物疾病模型在科研中發(fā)揮了巨大的作用,但也存在一些挑戰(zhàn)。
m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。protocol 分享|過表達細胞株的構(gòu)建。上海外包科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
細胞培養(yǎng)板的選購要注意哪些?寧夏乳鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗
把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話,要用TBST泡洗三遍再轉(zhuǎn)移至一抗溶液中,BSA封閉的可以直接轉(zhuǎn)移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個長方形,這里的寬與長相對應(yīng))不大于8毫米,我習(xí)慣置于15毫升離心管中孵育,兩條膜"背對背"式放置于一個管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米,就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過夜,一般是12-18個小時,注意放置水平,用搖床。內(nèi)參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現(xiàn)條帶連在一起的情況,這時可以縮短孵育時間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個小時足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗,這樣背景會干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液,我們一般一條膜一個槽地孵。2、顯影這一步有個細節(jié)可能有些同學(xué)沒注意到,就是ECL發(fā)光液要與HRP反應(yīng)一分鐘后顯影效果才會更好,還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋,一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。寧夏乳鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗