m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細(xì)胞實驗進(jìn)一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。分享的內(nèi)容能對大家有所幫助,想要了解更多,歡迎致電咨詢。浙江乳鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗室

外泌體的功能外泌體可能作為細(xì)胞之間物質(zhì)和信號通訊的途徑,不同的細(xì)胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實現(xiàn)細(xì)胞間通訊,這些外泌體被受體細(xì)胞吸收,通過物質(zhì)交換或釋放內(nèi)含物實現(xiàn)物質(zhì)和信號的交流。外泌體與受體細(xì)胞的信息交流可能通過以下4種途徑實現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質(zhì)被目的細(xì)胞表面的受體識別,從而靶細(xì)胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質(zhì)碎片可作為目的細(xì)胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細(xì)胞膜融合,將蛋白質(zhì)和RNA等內(nèi)容物釋放進(jìn)去,此類膜融合可能改變靶細(xì)胞的一些膜特性,例如脂質(zhì)和膜蛋白質(zhì)的密度及種類;目的細(xì)胞通過胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑,外泌體將其攜帶的生物信息運輸?shù)街苓叞屑?xì)胞或經(jīng)血液等體液運輸而被遠(yuǎn)處組織細(xì)胞攝取,進(jìn)而影響目的細(xì)胞的基本功能和基因表達(dá)。幾乎所有的細(xì)胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產(chǎn)生外泌體,不同的細(xì)胞產(chǎn)生的外泌體具有不同的功能,這些外泌體參與了一系列生理和病理過程,如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調(diào)節(jié)、組織愈合等。此外,外泌體與疾病的研究表明:外泌體可能在代謝性疾病的出現(xiàn)以及心血管健康中發(fā)揮作用。北京實驗科研技術(shù)服務(wù)外包干貨分享|選對實驗室常用培養(yǎng)基DMEM和1640。

把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話,要用TBST泡洗三遍再轉(zhuǎn)移至一抗溶液中,BSA封閉的可以直接轉(zhuǎn)移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個長方形,這里的寬與長相對應(yīng))不大于8毫米,我習(xí)慣置于15毫升離心管中孵育,兩條膜"背對背"式放置于一個管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米,就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過夜,一般是12-18個小時,注意放置水平,用搖床。內(nèi)參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現(xiàn)條帶連在一起的情況,這時可以縮短孵育時間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個小時足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗,這樣背景會干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液,我們一般一條膜一個槽地孵。2、顯影這一步有個細(xì)節(jié)可能有些同學(xué)沒注意到,就是ECL發(fā)光液要與HRP反應(yīng)一分鐘后顯影效果才會更好,還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋,一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。
|基因組DNA擴增|RNA擴增|克隆與表達(dá)克隆基因|克隆試劑盒|克隆篩選|感受態(tài)細(xì)胞|突變轉(zhuǎn)染|轉(zhuǎn)化|體外轉(zhuǎn)錄/翻譯|其它表達(dá)分析Northern印跡分析|分支DNA和mRNA定量|差別基因表達(dá)|反義寡核苷酸|RACE試劑盒|SAGE試劑盒|其它抗體蛋白A,GPLUS|抑制/凋亡抗體|信號分子抗體結(jié)構(gòu)蛋白抗體|磷酸化特異抗體|融合蛋白tag抗體非哺乳動物蛋白抗體|細(xì)胞周期蛋白抗體|轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白抗體|抗體制備佐劑|抗體片段|抗體同種型|抗體純化|抗體制備試劑盒|其它第二抗體westernblot二抗|免疫組化二抗|其它試劑盒ELISA試劑盒|免疫組化試劑盒|放射免疫試劑盒|westernblot試劑盒|流式細(xì)胞試劑盒|其它抗體相關(guān)siRNA|重組蛋白|白蛋白|試劑|其它分子生物學(xué)服務(wù)DNA提取/純化|DNA測序|第二代高通量測序|DNA保存和活化|基因合成|基因步行|基因組分析生物信息學(xué)|SNP檢測|實時定量PCR服務(wù)|文庫/載體構(gòu)建|寡核苷酸合成Oligo合成|實時PCROligo合成|其它細(xì)胞生物學(xué)服務(wù)細(xì)胞培養(yǎng)|流式細(xì)胞檢測|細(xì)胞毒性測試|細(xì)胞因子生物檢測|影像服務(wù)|篩選/發(fā)育服務(wù)|其它干細(xì)胞技術(shù)服務(wù)干細(xì)胞提取|干細(xì)胞鑒定|干細(xì)胞誘導(dǎo)分化|干細(xì)胞常規(guī)檢測|干細(xì)胞擴增|干細(xì)胞轉(zhuǎn)基因|干細(xì)胞其他相關(guān)實驗|微生物學(xué)服務(wù)微生物鑒定|抑菌作用測試|內(nèi)測試|內(nèi)。培養(yǎng)基有很多不同的名字是因為根據(jù)不同細(xì)胞的培養(yǎng)和應(yīng)用場景。

m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析(圖3)。EdU細(xì)胞增殖檢測是一種快速、準(zhǔn)確、靈敏的細(xì)胞增殖檢測方法.云南裸鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗
細(xì)胞污染的處理的技術(shù)。浙江乳鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗室
用伊紅乙醇液對比染色1~3min。(4)將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色,然后放入無水乙醇中3~5min,吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀察在鏡下可見卵巢呈扁橢圓形,表面為單層扁平上皮細(xì)胞或單層立方上皮,卵巢實質(zhì)分為皮質(zhì)和髓質(zhì)??梢娚掀ぃ悸雅莺蜕L卵泡。卵巢組織中各發(fā)育階段卵泡及卵巢基質(zhì)的形態(tài)結(jié)構(gòu)清晰可見,細(xì)胞核呈藍(lán)紫色,細(xì)胞質(zhì)及間質(zhì)成分呈淺紅色,卵泡中卵母細(xì)胞、卵泡細(xì)胞、透明帶均清晰可見。注意事項1.取材注意事項(1)取材動作要迅速,不宜作太久的拖延以免組織細(xì)胞的成分、結(jié)構(gòu)等發(fā)生變化。(2)切片材料應(yīng)根據(jù)需要觀察的部位進(jìn)行選擇,盡可能不要損傷所需要的部分。(3)切取的組織塊不宜太大,以利于固定劑穿透,通常以5mmx5mmx2mm或10mmx10mmx2mm為宜。2.固定注意事項(1)一般固定液,都以新配為好,配好后應(yīng)貯存在陰涼處,不宜放在日光下,以免引起化學(xué)變化,失去固定作用。(2)有些混合固定液的成份之間會發(fā)生氧化還原作用,一定要在使用前才混合,如果混合太早,固定時就沒有作用了。(3)固定材料時,固定液必須充足,一般為材料塊的20~30倍,有些水分多的材料,中間應(yīng)更換1~2次新液。(4)材料固定完畢后。浙江乳鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗室