m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析(圖3)??梢园l(fā)現(xiàn)與疾病發(fā)生相關(guān)的關(guān)鍵基因和蛋白質(zhì),從而為疾病的預(yù)防和檢查提供新的思路。廣西疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室

動(dòng)物模型在科研中有著普遍的應(yīng)用。首先,它們可以幫助科研人員深入理解的共同性,即不同物種之間存在的共有理變化過程。通過對(duì)動(dòng)物模型的研究,科研人員可以更清楚地了解的發(fā)展過程和機(jī)制,為人類的檢查提供理論依據(jù)。其次,動(dòng)物模型還為新研發(fā)和苗測(cè)試提供了的平臺(tái)。在研發(fā)過程中,科研人員可以通過對(duì)動(dòng)物模型進(jìn)行處理,觀察其和副作用,為新的臨床試驗(yàn)提供依據(jù)。而在苗測(cè)試中,動(dòng)物模型則可以用來評(píng)估苗的性和安全性。此外,動(dòng)物模型還為科研人員提供了研究人類的跨學(xué)科方法。例如,通過比較人類和動(dòng)物模型的基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等數(shù)據(jù),可以發(fā)現(xiàn)與發(fā)生相關(guān)的關(guān)鍵基因和蛋白質(zhì),從而為的和檢查提供新的思路。雖然動(dòng)物模型在科研中發(fā)揮了巨大的作用,但也存在一些挑戰(zhàn)。首先,由于物種差異的存在,動(dòng)物模型的表現(xiàn)與人類可能存在差異,因此需要謹(jǐn)慎使用。此外,動(dòng)物模型的倫理問題也不容忽視,科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進(jìn)行相關(guān)研究。盡管存在挑戰(zhàn),動(dòng)物模型的發(fā)展前景仍然值得期待。隨著科技的不斷進(jìn)步,科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實(shí)用的動(dòng)物模型。上海病理科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)科普知識(shí) —了解IgM、IgG、IgA、IgE四種抗體。

METTL3能夠促進(jìn)肺腺細(xì)胞的生長(zhǎng)、生存和侵襲,但還不清楚它是否作為m6A調(diào)節(jié)器或效應(yīng)器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細(xì)胞白血?。ˋML)患者中,m(6)A調(diào)控基因的突變或拷貝數(shù)變化與TP53突變存在密切聯(lián)系,且m(6)A調(diào)控基因的改變與AML不良預(yù)相關(guān)[26]。此外,F(xiàn)TO在AML中高表達(dá),它通過降低mRNA轉(zhuǎn)錄本中的m(6)水平,調(diào)節(jié)ASB2和RARA等靶點(diǎn)的表達(dá),增強(qiáng)了白血病基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病形成,并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導(dǎo)的AML細(xì)胞分化[27]。在脂肪形成過程中,F(xiàn)TO表達(dá)與m6A水平成負(fù)相關(guān),促進(jìn)脂肪形成[3]。在膠質(zhì)細(xì)胞瘤樣細(xì)胞中,ALKBH5通過lncRNAFOXM1介導(dǎo)FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質(zhì)瘤細(xì)胞的成瘤性[28]。此外,甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3或METTL14的敲除,能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達(dá),極大地促進(jìn)了膠質(zhì)瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)、自我更新和形成[29]。圖2m6ARNA修飾和介導(dǎo)的功能[30]m6A的研究方向主要是通過研究m6A修飾相關(guān)的甲基化、去甲基化酶和識(shí)別蛋白的功能,進(jìn)而研究m6A修飾的生物學(xué)功能和作用機(jī)制:一般通過敲除m6A酶分子,研究下游功能基因分子的表達(dá)和m6A甲基化情況,通過介導(dǎo)相關(guān)基因異常(可變剪切、穩(wěn)定性、翻譯、miRNA調(diào)控)影響細(xì)胞表型和功能特征。
二甲苯Ⅰ、Ⅱ各15min至透明。(2)放入二甲苯和石蠟等量混合液處理15min,再放入石蠟Ⅰ、Ⅱ透蠟各50~60min。透蠟在恒溫箱內(nèi)進(jìn)行,箱內(nèi)溫度保持在55~60℃左右。4、包埋(1)用鑷子夾取蠟?zāi)T诰凭珶羯仙约訜?,并倒入少許從溫箱中取出的純石蠟。(2)再將鑷子在酒精燈上稍加熱,夾取材料將切面朝下放入蠟?zāi)V校帕姓R,再放上包埋盒,輕輕倒入熔蠟。5、切片、展片、貼片(1)將包埋好的石蠟塊固定在切片機(jī)上,調(diào)整厚度調(diào)節(jié)器到所需的切片厚度,一般為4~6μm。(2)切下的組織薄片要放到加熱的水中燙平,再貼到載玻片上,放45℃恒溫箱中烘干。二、HE染色1、脫蠟、復(fù)水(1)保持水浴鍋溫度為60℃,將切片放入干燥的染色缸內(nèi),放入水浴鍋中,30min至蠟熔化。(2)石蠟切片經(jīng)二甲苯Ⅰ、Ⅱ脫蠟各5min,然后放入100%、95%、90%、80%、70%各級(jí)酒精溶液中各3~5min,再放入蒸餾水中3min,以便染料可以進(jìn)入組織。2、染色、脫水(1)切片放入蘇木精中染色約10~30min,用流水沖洗約15min,使切片顏色變藍(lán)。(2)將切片放入1%鹽酸乙醇液中褪色,幾秒后見切片變紅、顏色較淺即可,后將切片再放入流水中使其恢復(fù)藍(lán)色。(3)切片放入50%、70%、80%乙醇中各3~5min。動(dòng)物疾病模型可以分為兩種類型:自然模型和人工模型。

膿毒癥動(dòng)物模型必須具備以下基本要素:有膿毒癥典型的高排低阻血流動(dòng)力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài);伴發(fā)多個(gè)功能障礙;有較高的自然死亡率,根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸,要求動(dòng)物模型的自然死亡率達(dá)到50%~70%;膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過度造成的自身?yè)p傷,不是細(xì)菌和內(nèi)對(duì)機(jī)體的直接損傷,故出現(xiàn)功能障礙及動(dòng)物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時(shí)間間距。一般在制模后6~12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇在制作動(dòng)物模型時(shí)多選用雄性小鼠,因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克,且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大,而雄性小鼠在膿毒癥時(shí)更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型?盲腸結(jié)扎穿孔模型(CLP)模型是接近于人類膿毒癥機(jī)制的模型,被稱為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個(gè)階段:盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng),其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎,進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。常用于研究細(xì)胞的成瘤能力、細(xì)胞的轉(zhuǎn)移、細(xì)胞的耐藥和靶分子對(duì)腫瘤細(xì)胞的發(fā)展的影響等等。海南乳鼠科研技術(shù)服務(wù)分離
RNA提取過程中試劑的作用是什么?廣西疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
應(yīng)根據(jù)所檢測(cè)指標(biāo)的要求,需采取不同策略處理。在如今分子學(xué)當(dāng)?shù)赖默F(xiàn)實(shí)背景下,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)除了對(duì)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的體征及生理指標(biāo)進(jìn)行全的監(jiān)控外,各種分子檢測(cè)甚至是組學(xué)檢測(cè)也開始大行其道,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)束之后的機(jī)制研究成為了實(shí)驗(yàn)的重頭戲。一般來說,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)檢測(cè)對(duì)象主要包括:(1)體液中各類因子定性及定量檢測(cè)由于此類檢測(cè)對(duì)象多為蛋白及各類小分子物質(zhì),因此在取樣過程中應(yīng)注意防止此類物質(zhì)降解,在獲取后,應(yīng)及時(shí)置于溫(≤-80℃)進(jìn)行保存,在后續(xù)實(shí)驗(yàn)過程中,也應(yīng)當(dāng)注意保存條件的穩(wěn)定性,避免反復(fù)凍融。常用的方法便是酶聯(lián)免吸附測(cè)定(ELISA),除此之外,可利用生化分析儀及不同檢測(cè)方法的(比色法、比濁法等)方法對(duì)各類生化指標(biāo)及因子進(jìn)行定性及定量檢測(cè)。(2)生理變化及免組化檢測(cè)常用的理檢測(cè)多使用H&E染色對(duì)細(xì)胞質(zhì)及細(xì)胞核進(jìn)行染色標(biāo)記,以觀察細(xì)胞變化。除此之外,許多特殊染色也在理生理變化中得到了應(yīng)用,如利用Masson染色檢測(cè)纖維化變,Nissl染色檢測(cè)神經(jīng)元損傷,β-半乳糖甘酶染色檢測(cè)細(xì)胞衰老等。此外,還可以通過免組化技術(shù)對(duì)某些特異性標(biāo)記物進(jìn)行免顯色檢測(cè),達(dá)到原位定性或定量檢測(cè)的目的。。廣西疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室